MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 258 chromosome

Total Repeats: 43748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017945	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849361
2	NC_017945	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849361
3	NC_017945	A	6	6	187	192	100 %	0 %	0 %	0 %	389849361
4	NC_017945	ACT	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849361
5	NC_017945	TGCA	2	8	275	282	25 %	25 %	25 %	25 %	389849361
6	NC_017945	TGC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849361
7	NC_017945	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389849361
8	NC_017945	AT	3	6	412	417	50 %	50 %	0 %	0 %	389849361
9	NC_017945	TTC	3	9	456	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849361
10	NC_017945	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849361
11	NC_017945	CA	3	6	610	615	50 %	0 %	0 %	50 %	389849361
12	NC_017945	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849361
13	NC_017945	G	6	6	661	666	0 %	0 %	100 %	0 %	389849361
14	NC_017945	CTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849361
15	NC_017945	TTCC	2	8	710	717	0 %	50 %	0 %	50 %	389849361
16	NC_017945	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849361
17	NC_017945	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849361
18	NC_017945	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849361
19	NC_017945	AGCC	2	8	857	864	25 %	0 %	25 %	50 %	389849361
20	NC_017945	ATGC	2	8	922	929	25 %	25 %	25 %	25 %	389849361
21	NC_017945	AT	3	6	1005	1010	50 %	50 %	0 %	0 %	389849361
22	NC_017945	CAGG	2	8	1029	1036	25 %	0 %	50 %	25 %	389849361
23	NC_017945	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389849361
24	NC_017945	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849361
25	NC_017945	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849361
26	NC_017945	T	6	6	1126	1131	0 %	100 %	0 %	0 %	389849361
27	NC_017945	ACT	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849361
28	NC_017945	TACG	2	8	1223	1230	25 %	25 %	25 %	25 %	389849361
29	NC_017945	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849361
30	NC_017945	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849361
31	NC_017945	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849361
32	NC_017945	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849361
33	NC_017945	CGA	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849361
34	NC_017945	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849361
35	NC_017945	GATG	2	8	1560	1567	25 %	25 %	50 %	0 %	389849361
36	NC_017945	CG	3	6	1611	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	389849361
37	NC_017945	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	389849361
38	NC_017945	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849361
39	NC_017945	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849361
40	NC_017945	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849361
41	NC_017945	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849361
42	NC_017945	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849361
43	NC_017945	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017945	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017945	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389849362
46	NC_017945	AAC	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017945	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017945	GAG	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017945	GAAG	2	8	2429	2436	50 %	0 %	50 %	0 %	389849363
50	NC_017945	CCCA	2	8	2484	2491	25 %	0 %	0 %	75 %	389849363
51	NC_017945	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849363
52	NC_017945	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849363
53	NC_017945	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849363
54	NC_017945	GCT	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849363
55	NC_017945	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849363
56	NC_017945	CTGC	2	8	2769	2776	0 %	25 %	25 %	50 %	389849363
57	NC_017945	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849363
58	NC_017945	TC	3	6	3005	3010	0 %	50 %	0 %	50 %	389849363
59	NC_017945	GAAA	2	8	3255	3262	75 %	0 %	25 %	0 %	389849363
60	NC_017945	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849363
61	NC_017945	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849363
62	NC_017945	TTAC	2	8	3398	3405	25 %	50 %	0 %	25 %	389849363
63	NC_017945	GAG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849363
64	NC_017945	CTG	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017945	TCGT	2	8	3683	3690	0 %	50 %	25 %	25 %	389849364
66	NC_017945	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849364
67	NC_017945	AT	3	6	3782	3787	50 %	50 %	0 %	0 %	389849364
68	NC_017945	CTG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849364
69	NC_017945	TTG	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849364
70	NC_017945	GAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849364
71	NC_017945	GAG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849364
72	NC_017945	TCA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849364
73	NC_017945	A	6	6	4463	4468	100 %	0 %	0 %	0 %	389849364
74	NC_017945	GAC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849364
75	NC_017945	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849364
76	NC_017945	GCC	2	6	4734	4739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849364
77	NC_017945	AAGG	2	8	4839	4846	50 %	0 %	50 %	0 %	389849364
78	NC_017945	CTG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849365
79	NC_017945	AGA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849365
80	NC_017945	GCG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849365
81	NC_017945	TC	3	6	4956	4961	0 %	50 %	0 %	50 %	389849365
82	NC_017945	A	6	6	5024	5029	100 %	0 %	0 %	0 %	389849365
83	NC_017945	CGG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849365
84	NC_017945	TGG	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849365
85	NC_017945	A	6	6	5186	5191	100 %	0 %	0 %	0 %	389849365
86	NC_017945	AGC	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849365
87	NC_017945	AC	3	6	5199	5204	50 %	0 %	0 %	50 %	389849365
88	NC_017945	ATG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849365
89	NC_017945	ATAC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	389849365
90	NC_017945	TAA	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017945	CACGC	2	10	5735	5744	20 %	0 %	20 %	60 %	389849366
92	NC_017945	GTGGA	2	10	5772	5781	20 %	20 %	60 %	0 %	389849366
93	NC_017945	ATGC	2	8	5816	5823	25 %	25 %	25 %	25 %	389849366
94	NC_017945	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849366
95	NC_017945	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849366
96	NC_017945	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849366
97	NC_017945	ACC	3	9	6098	6106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849366
98	NC_017945	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849366
99	NC_017945	CGT	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849366
100	NC_017945	TGA	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
101	NC_017945	A	6	6	6261	6266	100 %	0 %	0 %	0 %	389849366
102	NC_017945	CCGATG	2	12	6273	6284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389849366
103	NC_017945	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849366
104	NC_017945	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849366
105	NC_017945	GAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849366
106	NC_017945	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389849366
107	NC_017945	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
108	NC_017945	GAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849366
109	NC_017945	TGA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
110	NC_017945	CG	3	6	6577	6582	0 %	0 %	50 %	50 %	389849366
111	NC_017945	AATCT	2	10	6609	6618	40 %	40 %	0 %	20 %	389849366
112	NC_017945	TCT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849366
113	NC_017945	GGC	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389849366
114	NC_017945	TGG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389849366
115	NC_017945	ATT	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389849366
116	NC_017945	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
117	NC_017945	CAA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389849366
118	NC_017945	GCT	3	9	7210	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849366
119	NC_017945	TTG	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849366
120	NC_017945	CCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389849366
121	NC_017945	GAA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849366
122	NC_017945	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389849366
123	NC_017945	GAT	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
124	NC_017945	ATG	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
125	NC_017945	TGA	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849366
126	NC_017945	TCG	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849366
127	NC_017945	A	6	6	7624	7629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017945	TAG	3	9	7673	7681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017945	CAG	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849367
130	NC_017945	T	6	6	7804	7809	0 %	100 %	0 %	0 %	389849367
131	NC_017945	TTC	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849367
132	NC_017945	GAG	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849367
133	NC_017945	AGC	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849367
134	NC_017945	TGC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849367
135	NC_017945	GAG	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389849367
136	NC_017945	AT	3	6	8127	8132	50 %	50 %	0 %	0 %	389849367
137	NC_017945	ATG	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017945	TA	4	8	8189	8196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017945	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017945	ACG	2	6	8240	8245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017945	TTC	2	6	8265	8270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017945	T	7	7	8287	8293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017945	ATT	2	6	8304	8309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389849368
144	NC_017945	TTA	2	6	8411	8416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017945	GAAA	2	8	8471	8478	75 %	0 %	25 %	0 %	389849369
146	NC_017945	CTG	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849369
147	NC_017945	TGT	2	6	8593	8598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389849369
148	NC_017945	CTG	2	6	8601	8606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849369
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152	NC_017945	TGA	2	6	8810	8815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849370
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161	NC_017945	TTC	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849371
162	NC_017945	CG	3	6	9582	9587	0 %	0 %	50 %	50 %	389849371
163	NC_017945	TGA	2	6	9600	9605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849371
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165	NC_017945	TCT	2	6	9681	9686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389849371
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174	NC_017945	CGA	2	6	10279	10284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389849371
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217	NC_017945	AGG	2	6	12298	12303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
218	NC_017945	TGT	2	6	12367	12372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_017945	GTT	2	6	13237	13242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
243	NC_017945	T	7	7	13260	13266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_017945	GT	3	6	13326	13331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
245	NC_017945	GGT	2	6	13358	13363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
246	NC_017945	T	6	6	13375	13380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_017945	GAC	2	6	13459	13464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_017945	CAA	2	6	13487	13492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389849375
249	NC_017945	CAT	2	6	13497	13502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389849375
250	NC_017945	TTGT	2	8	13533	13540	0 %	75 %	25 %	0 %	389849375
251	NC_017945	GCT	2	6	13579	13584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849375
252	NC_017945	CTG	2	6	13622	13627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389849375
253	NC_017945	TGA	2	6	13644	13649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849375
254	NC_017945	CCA	2	6	13660	13665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849375
255	NC_017945	GCCC	2	8	13683	13690	0 %	0 %	25 %	75 %	389849375
256	NC_017945	GAT	2	6	13768	13773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849375
257	NC_017945	TGA	2	6	13776	13781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849375
258	NC_017945	ACC	2	6	13801	13806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389849375
259	NC_017945	TGA	2	6	13851	13856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849375
260	NC_017945	GAA	2	6	13918	13923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389849375
261	NC_017945	AGTG	2	8	13932	13939	25 %	25 %	50 %	0 %	389849375
262	NC_017945	AGT	2	6	13992	13997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389849375
263	NC_017945	TTATC	2	10	14083	14092	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_017945	GAA	2	6	14364	14369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_017945	CGG	2	6	21251	21256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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